肛门直肠疾病的治疗以外治为主，内治为辅，但宜内外结合，尽量达到彻底根治、防止复发的目的。
　　（一）内治
　　1.清热凉血
　　适用于风热肠燥便血，或血栓外痔初起。方用凉血地黄汤或槐角丸加减。
　　2.清热利湿
　　适用于肛周脓肿实证，或痔核嵌顿，外痔肿痛，或肛瘘。方用草藓渗湿汤或龙胆泻肝汤加减。
　　3.清热解毒
　　适用于肛周脓肿实证，外痔肿痛。方用黄连解毒汤或龙胆泻肝汤加减。
　　4.清热通腑
　　适用于热结肠燥之便秘。方用大承气汤或麻仁丸加减。
　　5.生津润燥
　　适用于血虚津亏之便秘。方用润肠汤或麻仁丸加减。
　　6.补中益气
　　适用于少儿或年老体弱之直肠脱垂、痔核脱出。方用补中益气汤加减。
　　7.补益气血
　　适用于素体虚弱、气血亏虚之疾病后期或术后。方用八珍汤加减。
　　（二）外治
　　外治适用于痔核脱出，二、三期内痔，外痔，肛痿，肛周脓肿，陈旧性肛裂等。
　　1.熏洗法
　　以药物加水煮沸或散剂用开水冲泡先熏后洗，或用毛巾蘸药汁湿敷患处。常用药物有芒硝（消肿止痛）、l/5000高锰酸钾溶液（术后泡洗）、五倍子扬（收敛止血）、苦参汤（除湿杀虫止痒）。
　　2.敷药法
　　将药物（药膏）敷于患处，一般于每日大便后，先熏洗再敷药。常用药物有金黄膏（清热解毒消肿）、马应龙痔疮膏（解毒消肿止痛）、生肌玉红膏、九华膏（生肌收口）。
　　3.手术
　　手术是肛门直肠疾病的主要治疗方法，如内痔、息肉的结扎法，外痔的切除术，肛瘘的切除、挂线疗法，脱肛的注射疗法，肛裂的切除术，扩肛术等。各种治疗方法操作详见有关疾病。

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