东南大学公共卫生学院的前身为原南京铁道医学院预防医学系，创建于1976年，1999年更名为公共卫生学院，主要担负着为全国铁路系统培养预防医学专门人才的任务，同时围绕铁路运输，开展站车卫生、放射性物质运输等方面的科学研究，是铁道部卫生防疫工作人才培养和科学研究的重要基地，在全国铁路卫生系统具有广泛的影响。2000年，原铁道部所属的南京铁道医学院与教育部直属的重点大学----东南大学合并，组建新的东南大学，公共卫生学院成为东南大学下属的二级院系之一。
　　公共卫生学院现设有预防医学和劳动与社会保障（医疗保险专业方向）2个本科专业。预防医学专业是公共卫生学院的主干专业，设有劳动卫生与环境卫生学、卫生毒理学2个博士点，公共卫生与预防医学一级硕士点，公共卫生与预防医学博士后流动站，同时也是教育部批准的首批开展公共卫生硕士（MPH）试点单位之一。劳动与社会保障专业（医疗保险专业方向）开设于1995年，是我国最早设立的医疗保险方向的本科专业，也是教育部首批批准开设劳动与社会保障专业的9所试点院校中以医疗保险为专业特色的唯一一家。目前设有社会保障学硕士点，2005年被江苏省教育厅批准为省重点建设的特色专业。
　　公共卫生学院建院（系）之初，就较早地确立了教学科研并重的办院方针，在抓好人才培养质量的同时，围绕铁路和地方医疗卫生工作需要，积极开展科研工作。1999年，又在原有的教研室和研究室的基础上，组建了学科系，以学科系为中心，承担组织教学科研和管理的任务。目前学院设有4个学科系，即劳动卫生与环境卫生学系，营养与食品卫生学系，流行病与卫生统计学系以及医疗保险学系，涵盖了十多个教研室和研究室。此外，学院还设有预防医学、站车卫生、医疗保险、医学应用技术等4个研究所。劳动卫生与环境卫生学学科为江苏省重点学科，此外还有2个铁道部重点学科，1个与省CDC共建的重点实验室。学院是卫生部批准的保健功能食品检测单位。
　　学院现有教职工60余人，其中专任教师45人，教师中，现有博士生导师7人，教授（研究员）13人，副教授15人，具有博士学位和在读博士学位的教师占到教师总数的80%以上，硕士以上学位占到45岁以下教师总数的100%，此外还聘任基地研究生导师10名。学院现有在校本科生约430人，博士硕士生120人（不包括专业硕士）。近五年来学院承担国家自然基金、社会科学基金、国家863计划以及省自然基金等重点科研项目30项，科研经费近3000万元。特别是围绕学科建设，在加强学科交叉集成综合、开展理医工结合方面，取得了积极的进展。
　　学院拥有教学科研用房6000余平方米，各类仪器设备总值1500万元，建有教学实验中心、计算机中心和分析检测中心以及SPF动物实验室等，并在985 二期专项经费资助下，建成了开放式的“环境与健康”科技创新平台。

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