1）阐明复方的作用机制：复方作用的原理，可用药理学方法加以阐明。例如生脉散对动物实验性休克具有强心、升压作用。发现其强心作用系由于兴奋心肌的β受体，改善缺血心肌的合成代谢，抑制心肌细胞膜ATP酶活性，改善心肌细胞膜对某些阳离子的主动转运，并使心跳复搏等。这完全符合传统记载的益气养阴敛汗固脱的功能。

　　2）剖析药物的配伍关系：通过药理研究，可以了解复方中某些药物的配伍关系是协同作用（增强或相加），还是拮抗作用。前巳例举茵陈、栀子、大黄组成的茵陈蒿汤，利胆作用增强；柴胡和甘草或芍药合用，能降低柴胡的毒性反应等。再以六神丸为例，它由麝香、牛黄、蟾酥、雄黄、珍珠、龙脑六味药组成。现代研究证明，强心以蟾酥为主，系促进心肌能量代谢中必需蛋白激酶的生物合成；牛黄也有加强心脏收缩作用。抗炎作用研究提示，对毛细血管通透性有显著的抑制作用，比氢化考的松或芦丁强。牛黄和蟾酥配伍，蟾酥和麝香配伍都是相加作用；麝香与牛黄配伍为增强作用；故三药并用时作用显著增强，效力为芦丁的8倍。六神丸对肉芽肿形成也有抑制作用。当麝香、牛黄、蟾酥（2：3：3）配伍时有增强作用，效果为六神丸的8.2倍，比单味蟾酥大两倍多。又六神丸中的麝香、牛黄都能抑制白细胞游走；蟾酥单用则促进白细胞游走，但蟾酥与牛黄配伍，却使抑制作用增强。

　　3）提高对复方立法组方的理论认识：白虎加人参汤是知母、石膏、人参、甘草、粳米组成的古方。有人将其用于动物实验性糖尿病的研究，结果指出：用汤剂口服，可使四氧嘧啶性糖尿病小鼠血糖降低，单味知母或人参口服，也有相同作用，其他三药则无明显降血糖效果。如人参、知母合用，则降血糖作用有所拮抗。在二者比例为3：5时，尚有降血糖作用。如1.8：1时，则降血糖作用几乎消失。人参剂量越大，二者合用时降血糖作用越差，但加入石膏则作用增强。即当知母、人参在一定剂量比例配伍降糖作用减弱时，石膏加入可恢复其降血糖效能。如再加入甘草、粳米，也出现相加作用。

　　4）发现新用途：可进行老药新用，老方新用的研究。例如柴胡桂枝汤由柴胡、黄苓、半夏、芍药、桂枝、大枣、人参、甘草和生姜所组成，原以发热，微恶寒，肢节烦痛，微呕，心下支绪为主证。近由药理研究证明柴胡桂枝汤对蜗牛神经元的自发放电活动有抑制作用并有抗小鼠听源性惊厥作用。至于青皮、枳实抗休克作用的研究，生脉散、参麦饮药理研究都是老药新用的发展例证。这样从临床观察到实验研究，再从实验到临床，反复探讨，可以发现更多的效用。

　　5）创制新方：原由苏合香油、青木香、沉香、麝香、丁香等15味药组成的苏合香丸，精简而成六味药的冠心苏合丸（青木香、檀香、苏合香、冰片、乳香、朱砂），经药理实验以扩张冠脉增加冠脉流量为指标，发现苏合香、冰片作用显著，改变剂型后称苏冰滴丸。这是与苏合香丸差异很大的一张新设处方。由六神丸组方开始，以后围绕这张基本方而出现的救心丸、益心丸、环心丹、中国活心丹、麝香保心丸等都是据以创制的新方。