1.性状：黄酮类化合物多为结晶性固体，少数（如黄酮苷类）为无定形粉末。除二氢黄酮、黄烷醇等游离的苷元母核有旋光性外，其余则无光学活性。苷类由于在结构中引入糖的分子，故均有旋光性，且多为左旋。黄酮类化合物的颜色与分子中是否存在交叉共轭体系及助色团（OH、OCH3等）的种类、数目以及取代位置有关。黄酮、黄酮醇及其苷类多显灰黄至黄色，查耳酮为黄至橙黄色，而二氢黄酮、异黄酮类，因不具有交叉共轭体系或共轭链短，故不显色（二氢黄酮）或显微黄色（异黄酮）。

　　2.溶解性：一般游离苷元难溶或不溶于水，易溶于甲醇、乙醇、乙酸乙酯、乙醚等有机溶剂及稀碱水溶液中。相对而言，二氢黄酮比黄酮、黄酮醇、查耳酮在水中的溶解度稍大。花色苷元（花青素）类是以离子形式存在，具有盐的通性，故亲水性较强，水溶度较大。

　　黄酮类化合物的羟基糖苷化后，水溶度相应加大，而在有机溶剂中的溶解度则相应减小。

　　3.酸性与碱性

　　（1）酸性：黄酮类化合物分子中多具有酚羟基，显酸性，可溶于碱性水溶液、吡啶甲酰胺中。由于酚羟基数目及位置不同，酸性强弱也不同，以黄酮为例，其酚羟基酸性强弱顺序依次为：7，4′-二OH＞7或4′-OH＞一般酚OH＞5-OH.

　　此性质可用于提取、分离及鉴定工作。

　　（2）碱性：γ-吡喃环上的1-氧原子，有未共用的电子对，表现微弱的碱性，可与强无机酸，如浓硫酸、盐酸等生成盐，但生成的佯盐极不稳定，加水后即可分解。

　　4.显色反应：黄酮类化合物的颜色反应与分子中的酚羟基及γ-吡喃酮环有关。

　　（1）还原试验

　　1）盐酸-镁粉（或锌粉）反应：为鉴定黄酮类化合物最常用的颜色反应。多数黄酮、黄酮醇、二氢黄酮类化合物显橙红至紫红色，少数显紫至蓝色，当B环上有-OH或-OCH3取代时，呈现的颜色亦即随之加深。但查耳酮、儿茶素类则无该显色反应。异黄酮类除少数例外，也不显色。

　　2）四氢硼钠（钾）反应：NaBH4是对二氢黄酮类化合物专属性较高的一种还原剂。与二氢黄酮类化合物产生红至紫色。其他黄酮类化合物均不显色，可与之区别。

　　（2）金属盐类试剂的络合反应

　　1）铝盐：常用试剂为1%三氯化铝或硝酸铝溶液。生成的络合物多为黄色（λmax＝415nm），并有荧光，可用于定性及定量分析。

　　2）锆盐：用来区别黄酮类化合物分子中3或5-OH的存在。加2%二氯氧化锆（ZrOCl2）甲醇溶液到样品的甲醇溶液中，若黄酮类化合物分子中有游离的3-或5-0H存在时，均可反应生成黄色的锆络合物。但两种锆络合物对酸的稳定性不同。3-OH，4-酮基络合物的稳定性比5-OH，4-酮基络合物的稳定性强。当反应液中接着加入枸橼酸后，5-羟基黄酮的黄色溶液显著褪色，而3-羟基黄酮溶液仍呈鲜黄色。

　　3）三氯化铁反应：多数黄酮类化合物因分子中含有酚羟基，可呈蓝色。