本病是一种良性疾病，是否会发生恶变尚有争议。曾有文献报道对208例乳房导管内乳头状瘤病人追踪5～18年，未见恶变成癌。Haagesen等对427例导管乳头状瘤病人随访，1～22年仅有2例恶变，他们认为乳房导管内乳头状瘤是良性病变，是独立起源的，不应视为癌前病变。但Geschicketer、Buh-Jorgensen等则认为，乳房导管内乳头状瘤，是一种潜在的恶性肿瘤，他们对72例病人的观察中，19例导管内乳头状瘤与癌并存。国内文献报道的一般恶变率为6%～8%.

　　Kraus等(1962)认为，位居乳晕区的大导管的乳头状瘤多为单发，且甚少恶变，而Carter(1927)认为，位居乳晕区外的中小导管内的乳头状瘤，常为多发，较易恶变。有报道其恶变率占1/3.Haagensen(1971)通过临床观察认为本病是癌前病变。1988年有文献报道并分析了144例本病，单发为120例，癌变占5%，多发为24例，恶变率为8.3%.因此认为，导管内乳头状瘤无论发生于大、中、小导管内，都有一定的恶变几率。一般认为多发性导管内乳头状瘤病生物学特性倾向恶变，故称癌前期病变。Kraus等(1962)在文章中反复指出，乳头状瘤癌变一般恶性度较低，生长缓慢，但因处理不当而致复发或转移，造成不良后果并非少见。因此，慎重采取治疗措施甚为重要。