药用部位为种子、种子的一部分或种子的加工品，这类中药称为种子类中药。

　　其药用部位大多是完整的成熟种子，包括种皮和种仁两部分；种仁又包括胚乳和胚。也有用种子的一部分，有的用种皮，如绿豆衣；有的用假种皮，如肉豆蔻衣、龙眼肉；有的用除去种皮的种仁，如肉豆蔻；有的用胚，如莲子心；有的则用发了芽的种子，如大豆黄卷。极少数为发酵加工晶，如淡豆豉。

　　性状鉴定主要应注意种子的形状、大小、颜色、表面纹理、种脐、合点和种脊的位置及形态、质地、纵横剖面以及气味等。有的种子水浸后种皮显黏液，如葶苈子；有的种子水浸后种皮呈龟裂状，如牵牛子。

　　显微鉴定：种子主要包括种皮、胚乳和胚三部分。种子类中药的显微鉴别特征主要在种皮，因为种皮的构造因植物的种类而异，最富有鉴别意义。

　　种皮种皮常由下列一种或数种组织组成。表皮层；栅状细胞层；色素层；油细胞层；石细胞；营养层。

　　胚乳通常由贮藏大量脂肪油和糊粉粒的薄壁细胞组成。也有少数种子的种皮和外胚乳的折合层不规则地伸入内胚乳中，形成错入组织，如槟榔；也有为外胚乳伸入内胚乳中而形成的错入组织，如肉豆蔻。

　　胚是种子中未发育的幼体，包括胚根、胚芽、胚茎及子叶四部分。

　　在植物器官中只有种子含有糊粉粒。糊粉粒是种子中贮藏的颗粒状的蛋白质。