与此同时还必须指出，日俄之间仍存在着制约和影响两国经贸关系发展的不利因素：

　　1、经济不可能脱离政治而独立存在和运行。“北方四岛”问题一直是制约日俄经贸关系正常发展瓶颈，虽然日本企业界面对俄罗斯远东开发计划的极大吸引力，不断向政府施加压力，迫使政府的对俄政策由“政经不可分”转向“扩大均衡”以及之后的“多层次接触”，但笔者认为，在日俄两国领土问题未解决之前，日本政府不会无条件地对俄进行大规模的经济援助和投资，否则就等于日本自动放弃手中对俄唯一的“杠杆”。

　　2、日本与美国是传统意义上的盟国，日俄经贸关系的改善会受到美国的牵制。而对于日本来说，与美国的经济关系的重要性远远大于俄罗斯。因此，在发展与俄罗斯经贸关系上日本可能会有所顾虑。

　　3、俄罗斯毕竟曾是超级大国，对于它的东山再起，日本与所有西方其他国家一样存有一种戒备心理；而且，日本国内还有一部分人认为帮助俄罗斯经济改革取得成功会扩大俄罗斯在亚洲的影响，这对日本来说是不利的，因此在与俄的投资合作的技术交流方面日本 可能会有所保留。

　　4、在俄国境内的政治环境尚未完全稳定下来之前，没有政府的担保，日本恐怕不会大举投资俄罗斯的。而且，俄罗斯的经济中心在欧洲部分，远东地区自然条件恶劣，资源开发难度大，这对日俄发挥的地缘优势有相当的影响。

　　综合分析以上例举的利弊因素，笔者认为，尽管日俄经济贸易关系的发展困难重重，但两国出于各自经济利益的需要，势必要不断排除各种障碍，进一步扩大两国间的经济贸易关系，在一些领域加强合作，以形成互为补充的经济条件。实际上，为促进投资领域的合作，日俄两国政府都作出过努力。1993年在俄国前总统叶利钦访日时，双方签订了有关贸易和科技合作前景的宣言，其中表述了双方政府在基本经济合作方向上的立场，并且确定了以热能综合体、冶金工业、木材加工工业、运输、通讯等作为合作的领域。1994年11月双方签订了关于建立日俄两国政府间经贸问题委员会的备忘录。这里特别值得一提的是1997年12月签订的“桥本--叶利钦”计划，它为推动日本对俄投资打下了很好的基础。现在人们正期待着普京能与日本的当选首相也签订类似的“计划”，以更好的促进两国的经贸合作，并在电力、通信、生命科学、航空航天以及网络等高新技术领域有所进展和突破。因此，只要日俄两国首脑能够求同存异，努力为加强两国的经贸合作创造条件，日俄的经济贸易关系今后必将在矛盾、磨擦和协调中前进发展，前景应是相当广阔的。