1969年，匈牙利加入了海关合作委员会，而且是关税与贸易总协定和其他一些国际协定的签约国，并采用国际上普遍使用的“统一的商品种类和条码制度”。1995年12月1日，匈牙利颁布了海关法、海关程序与海关管理和关税的法案。多年来，匈牙利政府致力于贸易自由化，其中一项重要的举措就是逐步削减关税，匈牙利的关税水平总体上与西欧的标准一致。目前进口平均关税率为8%。
匈牙利海关根据世界国家经济发展程度的不同，实行区别对待的关税政策，除最惠国待遇外，给予一些发展中国家普惠制待遇、与中东欧国家按中欧自由贸易协定、与欧盟根据联系国协定规定的有关税率实行。根据中匈两国1990年签订的经贸协议，匈牙利给予中国最惠国待遇。
匈牙利海关对以下商品免税：
在运输途中受国际海关条约（TIR，ATA，Carnet）保护的应纳税商品；由承运人保管的应纳税商品；海关办公室先前用现金购得的商品；除应纳消费税的商品外，以来料加工的名义进口的应纳税产品；存放于保税库中的商品；由非匈公民带进匈牙利、以自用目的、使用不超过6个月的小轿车；以谋生和保证家庭至少12个月的供给为目的的、不超过普通家庭正常需求量而进入匈的移动资产等。
匈海关对于进入匈牙利国内流通领域的商品，除征收海关关税外，还应交纳普通流通税（税率分别为0%，12%，或25%——后者最常见）、消费税（依据增值税法）、统计费用和海关清关费（原产地为关税与贸易总协定国的产品，每批征收1%），还有目前暂时征收的8%的附加税。