大连海关将海关特殊监管区域及保税监管场所作为推动地方经济发展的引擎，充分发挥其功能优势，全力推动对外贸易结构优化、促进加工贸易转型升级。
目前，辽宁省共有4个海关特殊监管区域和1家保税物流中心以及48家保税仓库和出口监管仓。截止2011年11月底，大连关区特殊监管区域进出境货物53.13万吨，同比增长59.98%，进出口总值达26.68亿美元，同比增长54.4%。
“直通关”模式实现保税物流中心“区港联动”
2009年正式封关运作的营口港保税物流中心是国内唯一一家坐落于港区内的保税物流中心，同时也是东北地区第一家保税物流中心。
保税物流中心结合其坐落于港区内独特的区位优势，使中心业务与港口、铁路形成有效对接，开创了进出境货物无需转关即可进出保税物流中心的“直通关”监管模式，实现了真正意义的“区港联动”，大大降低了企业物流成本。目前，营口港保税物流中心已吸引鞍钢、本钢、中石化、富士康等50多家大型企业通过中心开展业务。
2010年，营口港保税物流中心货运量187万吨位居全国保税物流中心之首，进出口贸易额实现18.7亿美元，占营口地区进出口贸易额的三分之一强。2011年，中心发展势头更加强劲，截止至2011年11月底，中心实现进出口贸易额23.4亿美元。
“嵌入式”平台创新服务外包保税监管模式
大连国际服务外包保税研发测试中心是由大连高新区与大连海关共同创建的嵌入式软件保税监管服务平台。中心的创建创新了我国对国际服务外包业务进口货物海关保税监管的模式，也给企业带来了实实在在的甜头。中心自去年底投入试运营以来，已验放进出口报关单198票，货值405万美元。2011年，高新区软件和服务外包产业实现销售收入预计达到800亿元，同比增长一半以上。
主营打印机软件测试业务的柯尼卡美能达（大连）有限公司，是第一家入驻“保税研发测试中心”的企业，入驻后，公司进口的测试设备可直接运抵生产车间，现场办理查验放行手续。既能缩减测试时间，也可免交保证金，公司因此每年节约成本300万元，今年以来业务量同比增长了15%。
拓宽出口加工区物流功能 为企业量身打造通关模式
位于大连保税区出口加工区的英特尔公司同样也是海关特殊监管区域的一个受益者。由于出口加工区主要针对封闭式保税加工设置，本不具备保税物流功能。为满足英特尔大连项目的配套支撑需要，大连海关主动开展调研，选派业务骨干成立了保税监管科，专门负责英特尔大连芯片厂的日常通关业务，积极构建双向交流互动机制，采取多项措施拓展出口加工区的保税物流功能，便捷的特殊区域间货物流转手续，为企业节约了大量成本。
自2010年10月正式投产至今，英特尔大连公司申报进出口货物3万5千余票，进口总额为8.9亿美元，出口额高达15.4亿美元。在企业自身发展壮大的同时，更是为东北老工业基地振兴注入了强劲动力，拉动了地方经济的快速发展。英特尔中国区董事戈峻表示英特尔大连芯片厂将于近期实施扩大产能的重要步骤。
发挥“分拨集散”功能 积极吸引物流企业入区
大窑湾保税港区毅都集发冷藏物流有限公司，是一家专业经营冷链物流的企业，公司经理尤金介绍说：“大连海关针对我们冷库企业的特点，发挥保税港区出口分拨集散功能，积极协助并引导我们企业开展外发加工和出口农产品加工等新业务，在经营淡季时补足库容，维持运转，降低了企业物流成本”。目前，大窑湾保税港区冷链物流发展蓬勃发展，大窑湾保税港区成为东北地区保税肉类和水果的集散地，是冻羊肉进口全国第一大口岸，冻牛肉进口第三大口岸，水果进口第四大口岸。
大窑湾保税港区是继上海洋山保税港区之后第二个通过国家验收的保税港区。保税港区启用四年来，大连海关先后推出了“先提后报”、“车船直缺、“分批出区、集中报关”等便捷高效的通关措施，保税港区功能优势和便利措施吸引了众多跨国企业如佳能、东芝、英特尔等公司纷纷在大窑湾保税港区建立分拨中心、采购中心。四年来，大窑湾保税港区累计进出口货物2420万吨，货值626亿美元。

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